Обзор сотрудников лаборатории о современных подходах к измерению длины теломер принят к публикации в международном журнале
Статья принята к публикации в журнале Frontiers in Molecular Biosciences.
Обзорная статья сотрудников лаборатории посвящена современным подходам к измерению длины теломер и систематизирует более двух десятков существующих методик, включая TRF, Q-FISH, кПЦР, а также технологии на основе секвенирования длинными прочтениями. В работе рассмотрены преимущества и ограничения каждого подхода, приведена сравнительная таблица методов и перечень доступных биоинформатических инструментов.
Теломеры представляют собой ДНК-белковые комплексы на концах хромосом. Длина теломер сокращается при каждом делении соматической клетки, что позволяет рассматривать этот показатель как один из маркеров клеточного старения. Изменение длины теломер также связано с рядом возрастных заболеваний, особенностями образа жизни и развитием злокачественных новообразований. Учитывая высокий интерес к этой области, в последние годы активно появляются новые методы измерения длины теломер, а существующие подходы регулярно обновляются. Одним из стремительно развивающихся подходов является секвенирование длинными прочтениями, позволяющее анализировать длину теломер и их нуклеотидный состав на уровне отдельных хромосомных концов; этому подходу уделено особое внимание в настоящем обзоре.
Работа призвана помочь исследователям выбрать оптимальный подход в зависимости от целей конкретного проекта, требуемой точности, разрешения и производительности.
Авторы:
Ю. А. Макарова, У. Д. Белова, М. Э. Зверева, М. Ю. Шкурников, А. Г. Тоневицкий.
