Опубликован пресс-релиз про нетипичное синергичное действие изоформ микроРНК miR-93-5p при раке предстательной железы
На сайте НИУ ВШЭ вышел пресс-релиз (https://www.hse.ru/news/science/1152167635.html) на основании статьи про уникальные свойства микроРНК miR-93-5p (опубликована в журнале PeerJ https://peerj.com/articles/20642/). Исследователи НИУ ВШЭ обнаружили нетипичное поведение онкогенной микроРНК miR-93-5p при раке предстательной железы. Оказалось, что ее различные изоформы не меняют спектр генов-мишеней, а, напротив, усиливают действие друг друга.
МикроРНК играют ключевую роль в посттранскрипционной регуляции экспрессии генов, связываясь с комплементарными участками матричной РНК (мРНК) и подавляя трансляцию (синтез белка). В процессе биогенеза микроРНК их молекулы предшественники часто подвергаются неточному разрезанию, что приводит к образованию изоформ (изомиРНК). Традиционно считается, что 5'-изоформы, имеющие сдвиг в критически важном для связывания seed-регионе, должны иметь совершенно иной набор мРНК-мишеней (таргетом) по сравнению с канонической формой микроРНК.
Коллектив ученых НИУ ВШЭ (Антон Жиянов, Иван Кириллов, Роман Суворов, Диана Мальцева и Александр Тоневицкий) сфокусировался на изучении miR-93-5p — микроРНК с доказанной онкогенной активностью, которая высоко экспрессируется при раке предстательной железы. Для выявления мишеней 5'-изоформ исследователи использовали систему гиперэкспрессии на основе shRNA в клеточной линии аденокарциномы простаты PC-3.
Анализ данных РНК-секвенирования выявил перекрывание таргетомов канонической miR-93-5p и ее 5'-изоформ, последовательность seed-региона у которых сдвинута на 3 и 4 нуклеотида. Такое перекрывание объясняется одновременным присутствием сайтов связывания как для канонического, так и для сдвинутых seed-регионов в одних и тех же молекулах мРНК. Таким образом, гетерогенность 5'-конца в случае miR-93-5p не приводит к дивергенции мишеней. Вместо этого каноническая микроРНК и ее изоформы работают синергично, обеспечивая избыточное и более жесткое подавление общих транскриптов. Это может объяснять устойчивую онкогенную роль miR-93-5p при раке предстательной железы и её перспективность как потенциального биомаркера прогрессирования заболевания.
Результаты опубликованы 16 февраля в журнале PeerJ.
