Уникальность микроРНК miR-93-5p

МикроРНК miR-93-5p при раке предстательной железы сохраняет сходный набор мишеней даже при образовании 5’-изоформ. Это указывает на устойчивость её регуляторной функции к вариациям структуры

Результаты опубликованы в журнале PeerJ

© PeerJ

Опубликовано исследование сотрудников международной лаборатории микрофизиологических систем НИУ ВШЭ, посвященное особенностям работы микроРНК miR-93-5p при аденокарциноме предстательной железы.

МикроРНК регулируют экспрессию генов, связываясь с матричными РНК (мРНК) через так называемую seed-область. При альтернативном процессинге предшественников микроРНК могут формироваться 5’-изоформы с измененной последовательность seed-региона, что теоретически должно менять набор генов-мишеней. Однако для miR-93-5p была выявлена иная картина.

Эксперименты на клеточной линии с избыточной экспрессией 5’-изоформ (+3/+4) этой микроРНК показали подавление 54 мРНК. Анализ опухолевых образцов пациентов (данных TCGA) продемонстрировал, что большинство этих же генов отрицательно коррелируют и с канонической формой miR-93-5p. Это совпадение объясняется одновременным наличием как канонических, так и смещенных seed мотивов в одних и тех же мРНК-мишенях. Примечательно, что miR-93-5p вошла в число наиболее высоко экспрессированных микроРНК в клетках рака предстательной железы с относительно большим количеством транскриптов-мишеней, содержащих оба seed мотива.

Эти результаты предполагают существование «двойной архитектуры нацеливания», при которой каноническая форма микроРНК и её 5’-изоформы усиливают подавление одних и тех же транскриптов. Это может объяснять устойчивую онкогенную роль miR-93-5p при раке простаты и её перспективность как потенциального биомаркера прогрессирования заболевания.

Результаты опубликованы 16 февраля в журнале PeerJ.