Анализ одноклеточного секвенирования раскрыл различия микроокружения лево- и правостороннего колоректального рака
Сотрудники Международной лаборатории микрофизиологических систем представили обзор, посвященный одноклеточному анализу колоректального рака. В работе систематизированы современные данные, полученные с помощью технологий одноклеточного секвенирования РНК, с акцентом на фундаментальные различия между лево- и правосторонними опухолями.
Проведенный анализ демонстрирует, что лево- и правосторонний колоректальный рак (КРР) представляют собой гетерогенные заболевания с характерными микроокружением, метаболическими профилями и иммунным контекстом. Применение методов одноклеточного и пространственного транскриптомного анализа позволило идентифицировать специфические клеточные субпопуляции, сигнальные пути и межклеточные взаимодействия, определяющие прогрессирование опухоли, а также резистентность к терапии и метастатический потенциал. Особое внимание уделено исследованиям межклеточной коммуникации с использованием современных вычислительных подходов: в то время как для левостороннего КРР характерна активная коммуникация между опухолевыми клетками и фибробластами через сигнальные оси TGFB1-TGFBR1 и PLAU-PLAUR, в правостороннем КРР преобладают иммуноопосредованные взаимодействия, включая привлечение иммунных клеток через хемокин-опосредованные лиганд-рецепторные взаимодействия CCL15-CCR1 и CXCL16-CXCR6, а также иммуносупрессивные взаимодействия через SPP1-CD44 и TIGIT-NECTIN2.
Описанные наблюдения открывают новые перспективы для разработки персонализированных подходов к терапии, учитывающих не только анатомическую локализацию опухоли, но и клеточный состав её микроокружения. Результаты опубликованы в журнале Frontiers in Cell and Developmental Biology.
